<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">


<META content="MSHTML 6.00.2800.1515" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV><SPAN class=308034711-31082005><FONT size=3><STRONG>Ellman's 
Reagent</STRONG> </FONT></DIV>
<DIV>
<P>In order to quantitative available sulphydryl groups, the classic reagent is 
</SPAN>&nbsp;Ellman's reagent<SPAN class=308034711-31082005>, </SPAN><SPAN 
class=308034711-31082005>(</SPAN>DTNB<SPAN class=308034711-31082005>), 
which&nbsp;&nbsp;is used<SPAN class=308034711-31082005> </SPAN>for the 
modification of free thiols in proteins&nbsp; and peptides[1]</SPAN>. 
It&nbsp;<SPAN class=308034711-31082005>typically reacts with the thiol 
containing molecule to </SPAN>releasing the 5-thio-2-nitrobenzoate (TNB) anion, 
which absorbs<SPAN class=308034711-31082005>&nbsp;</SPAN>at 412 nm&nbsp;<SPAN 
class=308034711-31082005>(</SPAN>absorption coefficient of 13600 M&#8722;<SPAN 
class=308034711-31082005>1</SPAN>cm&#8722;<SPAN class=308034711-31082005>1</SPAN> 
[<SPAN class=308034711-31082005>2</SPAN>]<SPAN 
class=308034711-31082005>)</SPAN>.<SPAN class=308034711-31082005>&nbsp;It's 
presence can be plotted against a standard curve to determine the total amount 
of free thiols in proteins or peptide. </SPAN><SPAN 
class=308034711-31082005>Typically reactions arte conducted </SPAN>&nbsp;in 
phosphate buffer,&nbsp;<SPAN class=308034711-31082005>(0.1 M<SPAN 
class=308034711-31082005> </SPAN></SPAN>pH 7.2<SPAN class=308034711-31082005>) 
</SPAN>at 25 °C under&nbsp;<SPAN class=308034711-31082005>strictly 
</SPAN>anaerobic conditions<SPAN class=308034711-31082005>. Around </SPAN>3.6 x 
10-5 M of free thiol&nbsp;<SPAN class=308034711-31082005>is relatively easy to 
detect.&nbsp;Ten fold further dilution appears to be the limit of thee assay 
using 1 cm pathlength cells. </SPAN>A&nbsp;<SPAN class=308034711-31082005>double 
vacuum manifold </SPAN>system&nbsp;<SPAN class=308034711-31082005>(under Argon) 
</SPAN>and<SPAN class=308034711-31082005> a </SPAN>stoppered sidearm 
cuvette&nbsp;<SPAN class=308034711-31082005>are routinely used in our laboratory 
</SPAN>to maintain&nbsp;<SPAN class=308034711-31082005>strictly 
</SPAN>anaerobic<SPAN class=308034711-31082005> </SPAN>conditions.<SPAN 
class=308034711-31082005> Otherwise, oxidation to disulphides may occur 
preventing accurate quantification of the thiol groups present.</SPAN></P>
<P><SPAN class=308034711-31082005><STRONG>References</STRONG></SPAN></P>
<P><SPAN class=308034711-31082005></SPAN><SPAN class=308034711-31082005>[1] 
Riddles, P. W.; Blakely, R.; Zerner, B. Reassessment of Ellman's 
reagent.<STRONG> </STRONG><SPAN title="Methods in enzymology.">Methods 
Enzymol.</SPAN> 1983;91:49-60.</SPAN></P></DIV>
<DIV><SPAN class=308034711-31082005>[2] Li, T.-Y.; Minkel, D. T.; Shaw III, C. 
F.; Petering, D. H.&nbsp; Biochem. J. (1981) 193, 441-446.</SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=308034711-31082005></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=308034711-31082005>Dr. Fyaz M. D. Ismail</SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=308034711-31082005>Laboratory of Medicinal 
Chemistry</SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=308034711-31082005>Liverpool John Moores 
University,</SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=308034711-31082005>Byrom Street,</SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=308034711-31082005>Liverpool L3 3AF</SPAN><SPAN 
class=308034711-31082005></DIV>
<DIV><BR></DIV></SPAN>
<BLOCKQUOTE 
style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #0000ff 2px solid">
  <DIV class=OutlookMessageHeader dir=ltr align=left><FONT face=Tahoma 
  size=2>-----Original Message-----<BR><B>From:</B> 
  everybody-bounces@orglist.net [mailto:everybody-bounces@orglist.net]<B>On 
  Behalf Of </B>Anil Saini<BR><B>Sent:</B> 31 August 2005 10:59<BR><B>To:</B> 
  everybody@orglist.net<BR><B>Subject:</B> ORGLIST: Quantification of SH 
  group<BR><BR></FONT></DIV>
  <P>Helo to every one <BR>I want to know how to quantitate the sulfahydrl group 
  (-SH) in a linear peptide chain spectrophotometrically. and if there is any 
  other method to quantitate it what will be the strategy for 
  that.<BR><BR>another thing i want to know&nbsp; is that how to precipitate 
  urea from a solution of denatured protiens.<BR>I thanks in 
  advance<BR><BR><BR>Anil </P><BR><BR><A 
  href="http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/sigclick.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1507191490@Middle5?PARTNER=3"><IMG 
  hspace=0 
  src="http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/sigimpress.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1963059423@Middle5?OAS_query=null&amp;PARTNER=3" 
  border=0 NOSEND="1"></A> </BLOCKQUOTE></BODY></HTML>